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相见恨晚,生物科研在线工具
江莱生物 2022-08-31

苦逼的科研狗研究僧现在终于要开学,但工作效率不提高,头秃也还是不能毕业。做科研要有效率,互联网有很多有用的工具可以被利用,如果你还傻傻埋头干那是太不应该了。

今天,小编给“江米”们推荐几款科研在线工具,利器在精不在多,看看它们如何帮你渡劫!现在走起~

韦恩图 Venny2.1

实用指数:☆☆☆☆

韦恩图又称文氏图,用来表示几个数据集之间的关系,常见于转录组分析中差异表达基因的统计结果中。这款在线版的工具最多支持4组数据的韦恩图绘制,其操作非常简单,只需要将几组数据的列表输入到相应的list中,即可自动生成韦恩图。

工具地址:https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

生物计算器 NEBioCalculator

实用指数:☆☆☆☆

实验中,我们使用的最多的浓度是 ng/ul、uM 等,我们经常需要在不同的单位之间进行换算,而 dsDNA、ssDNA、ssRNA 的换算方式都不一样,而且每一次核苷酸的长度也不一样,生物计算器可以完美解决这些小麻烦。

工具地址:https://nebiocalculator.neb.com/#!/ligation

基因结构绘制 Exon-Intron Graphic Maker

实用指数:☆☆☆☆

Exon-Intron Graphic Maker。它可以根据序列长度等比例绘制gene的结构元件,比如5' UTR、 CDS、 外显子、内含子、突变位点、结构域、3' UTR等。它支持导出PDF格式的矢量图,可生成发表级质量的基因结构图。

工具地址:https://www.wormweb.org/exonintron

基因信息查找 Genecard

实用指数:☆☆☆☆

Genecards,是人类基因的综合数据库,提供简明的基因组,蛋白质组,转录,遗传和功能上所有已知和预测的人类基因。GeneCards中的信息功能信息包括指向疾病的关系,突变和多态性,基因表达,基因功能,途径,蛋白质与蛋白质相互作用等。

工具地址:https://www.genecards.org/

蛋白互作网络 String

实用指数:☆☆☆☆

String数据库是一个搜寻蛋白质之间相互作用的数据库。既包括蛋白质之间的直接物理相互作用,也包括蛋白质之间的间接功能相关性。它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还有利用生物信息学的方法预测的结果。

工具地址:https://string-db.org/

基因代谢通路注释 KEGG

实用指数:☆☆☆☆

KEGG是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库。把从已经完整测序的基因组中得到的基因目录与更高级别的细胞、物种和生态系统水平的系统功能关联起来是KEGG数据库的特色之一。KEGG的一个显著特点就是具有强大的图形功能,它利用图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系,这样可以使研究者能够对其所要研究的代谢途径有一个直观全面的了解。

工具地址:https://www.kegg.jp/

引物设计 Primer3Plus

实用指数:☆☆☆☆

严格的qPCR引物设计一般要求其中一条引物要跨外显子,最好在3' 端设计引物,产物的长度在300bp以内等。Primer3Plus可以满足qPCR引物设计的要求。

工具地址:https://www.primer3plus.com/

SCI写作 AI写作助手

实用指数:☆☆☆☆

AI写作助手搜索引擎实时收录全网Online的论文数据,基于BERT自然语言模型,根据大家输入的关键词或短语(中/英),系统会自动匹配语义最相近的英文表述方式。因此极大提高了大家的写作效率,特别是英文薄弱同学。

工具地址:https://www.home-for-researchers.com/

  小编今天的分享就到这里,希望本期整理推荐的,可以对各位搞科研工作的江米们有所帮助。


  文章来源于江莱生物(shjianglai666)

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