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狼疮性肾炎发病原因尚不明确。但总体来说，是遗传因素与环境因素相互作用的结果。一方面人体存在免疫调节方面的遗传缺陷，另一方面某些后天因素的刺激促使疾病的发生。这些后天因素包括食物、药物（肼屈嗪、普鲁卡因胺、甲基多巴、异烟肼、青霉素、D-青霉胺、氨基水杨酸等）、紫外线、微生物（细菌、病毒、寄生虫）以及吸烟和粉尘等。狼疮性肾炎在育龄期女性中的发病率显著高于其他人群，说明雌激素对疾病的发生也有一定影响。